ГПНИ «Конвергенция», 2011-2015 годы
Подпрограммы: «Математические методы»; «Физика фундаментальных взаимодействий и плазма»; «Современное естествознание и технологии будущего»
ГПНИ «Космические исследования», 2010-2012 годы
Разработка научных основ, технологий и перспективных инструментальных средств для проведения комплексных исследований космического пространства и использования космической информации
ГПНИ «Медицина и фармация», 2013–2015 годы
Сформирована из заданий ГПНИ «Фундаментальная и прикладная медицина и фармация» на 2011–2015 годы. Подпрограммы: «Фундаментальная и прикладная медицина»; «Химфармсинтез»
ГПНИ «Строительные материалы и технологии», 2011-2015 годы
Разработка теории и методологии создания строительных материалов с высокими потребительскими свойствами на заданный срок службы, научных принципов создания импортозамещающих экологически чистых строительных материалов и технологий, обеспечивающих энергоэффективность и эксплуатационную надежность
ГПНИ «Функциональные и композиционные материалы, наноматериалы», 2013–2015 годы
Сформирована из заданий ГПНИ «Функциональные и машиностроительные материалы, наноматериалы» на 2011–2015 годы и ГППНИ «Композиционные материалы» на 2009–2013 годы. Подпрограммы: «Кристаллические и молекулярные структуры»; «Наноматериалы и нанотехнологии»; «Функциональные материалы»; «материалы в технике»; «Высокоэнергетические технологии»
ГПНИ «Химические технологии и материалы, природно-ресурсный потенциал», 2013–2015 годы
Сформирована из заданий ГПНИ «Химические технологии и материалы» на 2011–2015 годы, подпрограммы «Химфармсинтез» ГПНИ «Фундаментальная и прикладная медицина и фармация» на 2011–2015 годы, ГПНИ «Природно-ресурсный потенциал» на 2011–2015 годы, ГПОФНИ «Биорациональные пестициды – 2» на 2009–2013 годы. Подпрограммы: «Химические технологии, реагенты, и материалы»; «Полимеры и композиты» «Химфармсинтез» «Природопользование - 2»; «Биоразнообразие, биоресурсы и экотехнологии»; «Радиация, экология и техносфера»; «Геологические модели»
ГПНИ «Энергобезопасность, энергоэффективность и энергосбережение, атомная энергетика», 2013–2015 годы
Программа сформирована из заданий ГПНИ «Энергобезопасность и надежность энергоснабжения» на 2011–2015 годы, ГПНИ «Энергоэффективность» на 2011–2015 годы, ГПНИ «Атомная энергетика, ядерные и радиационные технологии» на 2011–2015 годы. Подпрограммы: «Энергобезопасность»; «Надежность энергоснабжения» «Энергоэффективные технологии и техника»; «Энерго- и массоперенос»
ГППНИ «Композиционные материалы», 2009-2013 годы
Наукоемкие композиционные материалы, полученные методами порошковой металлургии, с использованием энергии взрыва, технологий сварки, резки, пайки, наплавки и нанесения защитных покрытий